1、管理模式不同WMS强调的是过程管理，面向的是过程的控制；而ERP仓储管理强调的是结果管理，面向的是财务的核算。
2、精细程度不同WMS利用条码技术对每个库区库位进行条码标识，上下架都需要进行扫描确认，保障每笔出入库业务的准确性，因而能实现精细的库存管理。同时，也可包容批次和唯一性管理，针对部分贵重物品或关键物料进行唯一性编码，增加物料管理的准确性；而ERP仓储管理虽然也将仓储划分库区库位，但因为没有过程的校验功能，很容易出现错放乱放的情况，导致库存管理非常凌乱，而且无法进行唯一化区别确认。
3、管理效率不同WMS能够通过扫描出入库及盘点，提高工作效率和准确性。 检测设备的集成不但减少了仓储人员的工作量，增加了物料质量追溯的完整性，更方便对供应商进行精细化考核；ERP仓储管理虽然可以集成了条码管理功能，但功能上存在缺陷，不能对其他企业的条码进行解析应用，没有和条码硬件及检测硬件的集成，导致最终不能实际应用。对于出入库、盘点、检验等业务仍需要手工输入，效率比较低下。
4、管理能力不同WMS适用于品种批次多，出入库频度高、对保质期和追溯性有很高要求的仓库；ERP仓库管理适用于品种批次少，出入库频率低、对保质期和追溯性要求较低的企业。
5、硬件集成应用不同WMS拥有条码、输送、叉车终端、检测等设备的集成，能够实现仓库作业管理的自动化应用；ERP仓储管理基本没有硬件的集成应用。
6、拓展性不同WMS灵活性很高，属于在基础软件框架上的二次开发，更贴近客户的需求；ERP仓储管理属于成型的软件模块，基本不支持客户化开发，不能完全贴近自己的需求。
目前电子商务行业主流的WMS（仓储管理系统）包括但不限于以下几种：
曼哈顿：曼哈顿的WMS系统在全球范围内都有应用，尤其在电子商务行业，它以其强大的功能和灵活性著称。
Infor：Infor提供了一系列的WMS解决方案，这些解决方案旨在满足不同规模和类型的电子商务企业的具体需求。
RP：虽然关于RP的详细信息较少，但它也被提及为电子商务行业中的一个主流WMS品牌。
皇家WMS：皇家科技WMS是国内知名的WMS产品之一，它为电子商务企业提供了一套完整的仓储管理解决方案。
易仓科技：易仓科技主要提供跨境电商ERP系统、国际货代物流系统TMS、海外仓管理系统WMS等服务，其WMS解决方案特别适合海外仓储及配送物流运营管理。
综上所述，这些WMS系统各有特点，企业应根据自身的实际需求和发展阶段选择合适的WMS系统。