自动化物流系统主要包括三大功能系统

国际商品交易合同的签订与履行过程，就是国际物流系统的实施的过程。国际物流系统是在国际信息系统的支撑之下（服务之下），借助于运输和储运等作业的参与，由进出口中间商协凋，通过国际物流设施，而构建起的一个遍布国内外，纵横交错、四通八达的物流运输网络。

电子商务宏观物流系统是包括由运输基础设施、仓储基础设施、互联网络系统等构成的物流基础设施系统。

医院物流系统是通过对医院物流的采购计划管理、订单管理、库存管理、耐用品管理、应付款管理、供应商管理等环节来实现规范医院物流管理，体现“适时、适量、适价、适质”的先进采购管理思想，并以最经济的资金占用率，保证物料的充分供应，减少库存资金占用，加快库存资金周转速度，降低医院运营成本，提高医院物流管理水平。

物流系统的输入包括自然资源（土地、设施、设备）、人、财务和信息资源。物流系统的处理过程就是通过管理主体对物流活动以及这些活动所涉及的资源进行计划、执行、控制，最终高效完成物流任务。
物流系统输出就是物流服务，包括组织竞争优势、时间和空间效用以及物资（原材料、在制品、制成品）向客户的有效移动。  物流系统处理过程的物流活动，是增值性经济活动，又是增值加成本、增加环境处理过程的物流活动，是增值性经济活动，又是增加成本、增加环境负担的经济活动，因此，对物流活动的认识，应当是研究物流管理的一个基本点。
具体内容包括以下几个方面：用户服务、需求预测、订单处理、配送、存货控制、运输、仓库管理、工厂和仓库的布局与选址、搬运装卸、采购、包装、情报信息。

国际商品交易合同的签订与履行过程，就是国际物流系统的实施的过程。国际物流系统是在国际信息系统的支撑之下（服务之下），借助于运输和储运等作业的参与，由进出口中间商协凋，通过国际物流设施，而构建起的一个遍布国内外，纵横交错、四通八达的物流运输网络。