1、管理模式不同WMS强调的是过程管理，面向的是过程的控制；而ERP仓储管理强调的是结果管理，面向的是财务的核算。
2、精细程度不同WMS利用条码技术对每个库区库位进行条码标识，上下架都需要进行扫描确认，保障每笔出入库业务的准确性，因而能实现精细的库存管理。同时，也可包容批次和唯一性管理，针对部分贵重物品或关键物料进行唯一性编码，增加物料管理的准确性；而ERP仓储管理虽然也将仓储划分库区库位，但因为没有过程的校验功能，很容易出现错放乱放的情况，导致库存管理非常凌乱，而且无法进行唯一化区别确认。
3、管理效率不同WMS能够通过扫描出入库及盘点，提高工作效率和准确性。 检测设备的集成不但减少了仓储人员的工作量，增加了物料质量追溯的完整性，更方便对供应商进行精细化考核；ERP仓储管理虽然可以集成了条码管理功能，但功能上存在缺陷，不能对其他企业的条码进行解析应用，没有和条码硬件及检测硬件的集成，导致最终不能实际应用。对于出入库、盘点、检验等业务仍需要手工输入，效率比较低下。
4、管理能力不同WMS适用于品种批次多，出入库频度高、对保质期和追溯性有很高要求的仓库；ERP仓库管理适用于品种批次少，出入库频率低、对保质期和追溯性要求较低的企业。
5、硬件集成应用不同WMS拥有条码、输送、叉车终端、检测等设备的集成，能够实现仓库作业管理的自动化应用；ERP仓储管理基本没有硬件的集成应用。
6、拓展性不同WMS灵活性很高，属于在基础软件框架上的二次开发，更贴近客户的需求；ERP仓储管理属于成型的软件模块，基本不支持客户化开发，不能完全贴近自己的需求。
该系统可以独立执行库存操作，与其他系统的单据和凭证等结合使用，可提供更为完整全面的企业业务流程和财务管理信息。 现代供应链管理的核心目标在于消灭一切无效的活动，而仓储管理在整个供应链当中起着举足轻重的作用。
就库存管理而言，WMS系统将会企业很好的调控作用。WMS系统能够实现保证企业生产、经营需求的前提下，使库存量经常保持在合理的水平上；掌握库存量动态，适时，适量提出订货，避免超储或缺货；减少库存空间占用，降低库存总费用；控制库存资金占用，加速资金周转。
自动化立体仓库的使用设备是什么？
货架自动化立体仓库简称立体仓库。一般是指采用几层、十几层乃至几十层高的货架储存单元货物，用相应的物料搬运设备进行货物入库和出库作业的仓库。由于这类仓库能充分利用空间储存货物，故常形象地将其称为“立体仓库”。 自动化立体仓库是现代物流系统中迅速发展的一个重要组成部分, 它具有节约用地、减轻劳动强度、消除差错、提高仓储自动化水平及管理水平、提高管理和操作人员素质、降低储运损耗、有效地减少流动资金的积压、提高物流效率等诸多优点。 与厂级计算机管理信息系统联网以及与生产线紧密相连的自动化立体仓库更是当今CIMS(计算机集成制造系统)及FMS(柔性制造系统)必不可少的关键环节。
自动化立体仓库的组成部分：
1、货架：
用于存储货物的钢结构。目前主要有焊接式货架和组合式货架两种基本形式。
2、托盘（货箱）：
用于承载货物的器具，亦称工位器具。
3、巷道堆垛机:
用于自动存取货物的设备。按结构形式分为单立柱和双立柱两种基本形式；按服务方式分为直道、弯道和转移车三种基本形式。
4、输送机系统:
立体库的主要外围设备，负责将货物运送到堆垛机或从堆垛机将货物移走。输送机种类非常多，常见的有辊道输送机，链条输送机，升降台，分配车，提升机，皮带机等。
5、AGV系统:
即自动导向小车。根据其导向方式分为感应式导向小车和激光导向小车。
6、自动控制系统:
驱动自动化立体库系统各设备的自动控制系统。目前以采用现场总线方式为控制模式为主。
7、储存信息管理系统:
亦称中央计算机管理系统。
是全自动化立体库系统的核心，目前典型的自动化立体仓库系统均采用大型的数据库系统（如ORACLE，SYBASE等）构筑典型的客户机/服务器体系，可以与其他系统（如ERP系统等）联网或集成。
自动化立体仓库的应用领域：
1.医药生产：
医药生产是最早应用自动化立体仓库的领域之一，1993年广州羊城制药厂建成了国内最早的医药生产用自动化立体库。此后，吉林敖东、东北制药、扬子江制药、石家庄制药、上药集团等数十个企业成功应用自动化立体仓库。
2.汽车制造：
国内最早应用应用自动化立体仓库的领域之一。中国二汽是最早应用自动化立体仓库的单位。目前国内主要汽车制造企业几乎无一例外的应用自动化立体仓库。
3.机械制造：
是广泛应用自动化立体仓库的领域之一。如三一重工等。
4.电子制造：
联想等电子领域在2000年后开始采用自动化立体仓库系统。
5.烟草制造业：
国内采用自动化立体仓库最普遍的行业。而且大量采用进口设备。