→电商销售管理即订单管理系统（OMS），包括全渠道订单对接管理、销售订单管理、套餐管理、拆单合单管理、分仓管理、物流渠道分配管理、退货管理、换货管理、售后跟单管理等功能。
→仓库管理系统（WMS），包括货位管理、出入库策略管理、库存归并策略管理、收货管理、上架管理、波次拣货管理、配单配货管理、打包管理、出库管理、盘点管理、库存调整管理、移库管理等功能。
→核算与结算管理系统（BMS），包括标准价格管理、合同管理、计费方案管理、应收应付账款管理、充值管理、对账单管理，总账管理等功能。
→客户关系管理系统，包括客户档案管理、店铺管理、客户货品管理、收发货地址管理、客户服务管理等功能。→统计分析系统，包括业务数据、作业数据、财务数据等统计分析功能。
→应用系统集成（API）平台，系统通过统一API平台与电子商务商城平台、电子商务ERP、物流渠道对接，实现商流、物流、信息流互联互通。
→物流作业辅助系统集成，系统可集成移动手持终端系统、电子标签拣货系统、移动拣货车系统、自动化拣货系统、电子标签打印系统等物流作业辅助系统。
效率不同ERP仓储管理部分厂家也集成了条码管理功能，但功能更上存在缺陷，不能对其他厂家的条码进行解析应用，没有和条码硬件及检测硬件的集成，导致最终不能实际应用，出入库、盘点、检验等业务仍需要手工输入，效率低下。
WMS则解决了以上的问题，通过扫描出入库及盘点增加了工作效率及准确率，而和检测设备的集成不但减少了仓储人员的工作量，增加了物料质量追溯的完整性，方便对供应商进行精细化考核。 适用范围不同ERP仓库管理适用于品种批次不多，出入库频率不高、对保质期和追溯性要求不高的企业，WMS则适用于品种批次较多，出入库频度很高、对保质期和追溯性有很高要求的仓库。
硬件集成应用不同ERP仓储管理基本没有硬件的集成应用，WMS则和条码设备、输送设备、叉车终端、检测设备等集成，实现仓库作业管理的自动化应用。 拓展性不同ERP仓储管理属于成型的软件模块，基本不支持客户化开发，不能完全贴近自己的需求。WMS则灵活性很高，属于在基础软件框架上的二次开发，更贴近客户的需求。
管理方式不同ERP仓储管理强调的是结果管理，WMS强调的是过程管理。ERP仓储管理是面向财务核算，WMS则是面向过程控制。 精细程度不同ERP仓储管理虽然也将仓储划分为库区库位，但因为没有过程的校验功能，很容易出现错放乱放的情况，导致库存管理的凌乱。
而WMS则利用条码技术对每个库区库位进行条码标识，上下架都需要进行扫描确认，可以保障每笔出入库业务的准确性，因而能实现精细的库存管理。ERP仓储管理一般能实现物料的批次管理，没办法进行唯一化区别确认。而WMS则可包容批次管理及唯一性管理，针对部分贵重物品或关键物料进行唯一性编码，增加物料管理的准确性。
仓储管理系统（WMS）是一个实时的计算机软件系统，它能够按照运作的业务规则和运算法则（algorithms），对信息、资源、行为、存货和分销运作进行更完美地管理，使其最大化满足有效产出和精确性的要求。这里所称的“仓储”包括生产和供应领域中各种类型的储存仓库和配送中心，当然包括普通仓库, 物流仓库以及货代仓库。 其基本有以下模块：收货处理、上架管理、拣货作业、月台管理、补货管理、库内作业、越库操作、循环盘点、RF操作、加工管理、矩阵式收费。