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ERP仓储管理虽然也将仓储划分为库区库位，但因为没有过程的校验功能，很容易出现错放乱放的情况，导致库存管理的凌乱。而WMS则利用条码技术对每个库区库位进行条码标识，上下架都需要进行扫描确认，可以保障每笔出入库业务的准确性，因而能实现精细的库存管理。
ERP仓储管理一般能实现物料的批次管理，没办法进行唯一化区别确认。而WMS则可包容批次管理及唯一性管理，针对部分贵重物品或关键物料进行唯一性编码，增加物料管理的准确性。适用范围不同 ERP仓库管理适用于品种批次不多，出入库频率不高、对保质期和追溯性要求不高的企业，WMS则适用于品种批次较多，出入库频度很高、对保质期和追溯性有很高要求的仓库。
硬件集成应用不同 ERP仓储管理基本没有硬件的集成应用，WMS则和条码设备、输送设备、叉车终端、检测设备等集成，实现仓库作业管理的自动化应用。拓展性不同 ERP仓储管理属于成型的软件模块，基本不支持客户化开发，不能完全贴近自己的需求。WMS则灵活性很高，属于在基础软件框架上的二次开发，更贴近客户的需求 。
1、管理模式不同WMS强调的是过程管理，面向的是过程的控制；而ERP仓储管理强调的是结果管理，面向的是财务的核算。
2、精细程度不同WMS利用条码技术对每个库区库位进行条码标识，上下架都需要进行扫描确认，保障每笔出入库业务的准确性，因而能实现精细的库存管理。同时，也可包容批次和唯一性管理，针对部分贵重物品或关键物料进行唯一性编码，增加物料管理的准确性；而ERP仓储管理虽然也将仓储划分库区库位，但因为没有过程的校验功能，很容易出现错放乱放的情况，导致库存管理非常凌乱，而且无法进行唯一化区别确认。
3、管理效率不同WMS能够通过扫描出入库及盘点，提高工作效率和准确性。 检测设备的集成不但减少了仓储人员的工作量，增加了物料质量追溯的完整性，更方便对供应商进行精细化考核；ERP仓储管理虽然可以集成了条码管理功能，但功能上存在缺陷，不能对其他企业的条码进行解析应用，没有和条码硬件及检测硬件的集成，导致最终不能实际应用。对于出入库、盘点、检验等业务仍需要手工输入，效率比较低下。
4、管理能力不同WMS适用于品种批次多，出入库频度高、对保质期和追溯性有很高要求的仓库；ERP仓库管理适用于品种批次少，出入库频率低、对保质期和追溯性要求较低的企业。
5、硬件集成应用不同WMS拥有条码、输送、叉车终端、检测等设备的集成，能够实现仓库作业管理的自动化应用；ERP仓储管理基本没有硬件的集成应用。
6、拓展性不同WMS灵活性很高，属于在基础软件框架上的二次开发，更贴近客户的需求；ERP仓储管理属于成型的软件模块，基本不支持客户化开发，不能完全贴近自己的需求。
第一类是基于典型的配送中心业务的应用系统，在销售物流中如连锁超市的配送中心，在供应物流中如生产企业的零配件配送中心，都能见到这样的案例。该系统的目标，一是落实国家有关医药物流的管理和控制标准GSP等，二是优化流程，提高效率。 系统功能包括进货管理、库存管理、订单管理、拣选、复核、配送、RF终端管理、商品与货位基本信息管理等功能模块；通过网络化和数字化方式，提高库内作业控制水平和任务编排。该系统把配送时间缩短了50%，订单处理能力提高了一倍以上，还取得了显著的社会效益，成为医药物流的一个样板。 此类系统多用于制造业或分销业的供应链管理中，也是WMS中最常见的一类。
第二类是以仓储作业技术的整合为主要目标的系统，解决各种自动化设备的信息系统之间整合与优化的问题。该系统主要解决原材料库（钢坯）、半成品库（粗轧中厚板）与成品库（精轧薄板）之间的协调运行问题，否则将不能保持连续作业，不仅放空生产力，还会浪费能源。
该系统的难点在于物流系统与轧钢流水线的各自动化设备系统要无缝连接，使库存成为流水线的一个流动环节，也使流水线成为库存操作的一个组成部分。各种专用设备均有自己的信息系统，WMS不仅要整合设备系统，也要整合工艺流程系统，还要融入更大范围的企业整体信息化系统中去。此类系统涉及的流程相对规范、专业化，多出现在大型ERP系统之中，成为一个重要组成部分。第三类是以仓储业的经营决策为重点的应用系统，其鲜明的特点是具有非常灵活的计费系统、准确及时的核算系统和功能完善的客户管理系统，为仓储业经营提供决策支持信息。此类系统多用于一些提供公仓仓储服务的企业中，其流程管理、仓储作业的技术共性多、特性少，所以要求不高，适合对多数客户提供通用的服务。采用了一套适合自身特点的WMS以后，减少了人工成本，提高了仓库利用率，明显增加了经济效益。
管理方式不同ERP仓储管理强调的是结果管理，WMS强调的是过程管理。ERP仓储管理是面向财务核算，WMS则是面向过程控制。 精细程度不同ERP仓储管理虽然也将仓储划分为库区库位，但因为没有过程的校验功能，很容易出现错放乱放的情况，导致库存管理的凌乱。
而WMS则利用条码技术对每个库区库位进行条码标识，上下架都需要进行扫描确认，可以保障每笔出入库业务的准确性，因而能实现精细的库存管理。ERP仓储管理一般能实现物料的批次管理，没办法进行唯一化区别确认。
而WMS则可包容批次管理及唯一性管理，针对部分贵重物品或关键物料进行唯一性编码，增加物料管理的准确性。 效率不同ERP仓储管理部分厂家也集成了条码管理功能，但功能更上存在缺陷，不能对其他厂家的条码进行解析应用，没有和条码硬件及检测硬件的集成，导致最终不能实际应用，出入库、盘点、检验等业务仍需要手工输入，效率低下。
WMS则解决了以上的问题，通过扫描出入库及盘点增加了工作效率及准确率，而和检测设备的集成不但减少了仓储人员的工作量，增加了物料质量追溯的完整性，方便对供应商进行精细化考核。 适用范围不同ERP仓库管理适用于品种批次不多，出入库频率不高、对保质期和追溯性要求不高的企业，WMS则适用于品种批次较多，出入库频度很高、对保质期和追溯性有很高要求的仓库。
硬件集成应用不同ERP仓储管理基本没有硬件的集成应用，WMS则和条码设备、输送设备、叉车终端、检测设备等集成，实现仓库作业管理的自动化应用。拓展性不同ERP仓储管理属于成型的软件模块，基本不支持客户化开发，不能完全贴近自己的需求。WMS则灵活性很高，属于在基础软件框架上的二次开发，更贴近客户的需求。