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1、管理模式不同WMS强调的是过程管理，面向的是过程的控制；而ERP仓储管理强调的是结果管理，面向的是财务的核算。
2、精细程度不同WMS利用条码技术对每个库区库位进行条码标识，上下架都需要进行扫描确认，保障每笔出入库业务的准确性，因而能实现精细的库存管理。同时，也可包容批次和唯一性管理，针对部分贵重物品或关键物料进行唯一性编码，增加物料管理的准确性；而ERP仓储管理虽然也将仓储划分库区库位，但因为没有过程的校验功能，很容易出现错放乱放的情况，导致库存管理非常凌乱，而且无法进行唯一化区别确认。
3、管理效率不同WMS能够通过扫描出入库及盘点，提高工作效率和准确性。 检测设备的集成不但减少了仓储人员的工作量，增加了物料质量追溯的完整性，更方便对供应商进行精细化考核；ERP仓储管理虽然可以集成了条码管理功能，但功能上存在缺陷，不能对其他企业的条码进行解析应用，没有和条码硬件及检测硬件的集成，导致最终不能实际应用。对于出入库、盘点、检验等业务仍需要手工输入，效率比较低下。
4、管理能力不同WMS适用于品种批次多，出入库频度高、对保质期和追溯性有很高要求的仓库；ERP仓库管理适用于品种批次少，出入库频率低、对保质期和追溯性要求较低的企业。
5、硬件集成应用不同WMS拥有条码、输送、叉车终端、检测等设备的集成，能够实现仓库作业管理的自动化应用；ERP仓储管理基本没有硬件的集成应用。
6、拓展性不同WMS灵活性很高，属于在基础软件框架上的二次开发，更贴近客户的需求；ERP仓储管理属于成型的软件模块，基本不支持客户化开发，不能完全贴近自己的需求。
员工：省时省力准确率高库存与生产、销售相互依赖又相互制约，生产与销售决定着库存的周转率，同时，库存也制约着企业的销售与生产，只有将每一环节管理得当才能使企业正常运作，获得更多的利润。
传统的仓库管理依赖员工记忆和经验，导致差错率较高；而且不能严格执行先进先出，有时对于员工任务安排不合理，各种作业路线没有规划；再加上人工本来就容易出错，结果是库存不准确、盘点也不准确。 使用WMS仓储管理系统进行合理规范的库存管理，降低对人的依赖，库存准确率高，加上编码管理货品，可以严格执行先进先出。
杜绝仓库产品过期的风险。不仅能减轻仓库人员的压力，还能提高库存准确率，对于仓库人员而言是很大的优势。
基层管理者：方便查询与管理使用WMS系统之后，管理将更加规范。商品出入仓库都输入到系统中，降低了人工出错的几率，仓库的账目也可以做到实时、同步、可视，方便数据查询和期末盘点，不会造成仓储数据不全的问题，同时避免积压产生呆滞物料。
仓管人员分配好职责，现场作业进度可视化，员工的劳动效率就可以得到提高。及时将库存商品ABC分类，方便拣货人员处理。同时也可以了解动态库存，进行及时有效的补货。
企业：为决策提供参考通过仓库管理系统，可以连通供应链上下游信息，对于原材料的采购、物流公si的预约能够及时进行有效的沟通，保证信息的通畅。同时，WMS对于企业扩大之后建设集团统一仓储信息平台有重要意义。
另一方面，仓库与销售是实时同步的，利用WMS可以及时把仓库数据转化为市场信息，进而为相关管理者提供决策依据。从这一点来看，仓库管理系统已经成为企业信息系统不可缺少的一部分。通过WMS系统，可以了解到企业内部商品的库存情况和销售情况，有利于企业作出更好的决策。