简单来讲，可以从非专业角度看，两者的区别不是很显著的区别：
跨境电商仓库系统是以仓储作业位基础的，专门针对整个仓库业务流程来进行管理，进销存管理是以货品的进货、销售、库存为主，其实销售也是货品出库的范畴，只是加入了价格管理，注重的是财务方面的管理，着重管账。
 
企业发展到一定阶段需要对仓库进行管理，此时需要选购相应的软件系统。由于在思路上不是非常的清晰，且缺乏相应的经验，在选购系统会出现选择了进销存后发现对仓库管理不够精细，或是购买了跨境电商仓库系统发现其实自身对于账务管理的需求才是最主要的问题。
 
先从事物最基础的逻辑进行分析，财务和仓储是两种不同的业务，从管理角度看，管理账务与管理货品的也不应当是同一个人。当企业需要购买系统用以应对仓库管理的时候，问题也往往出现在这里。这个时候采购软件通常依照的是这个岗位上的人员意见，从他的“角度”看，当然是进销存是最好的选择。
如此一来，财务能够管一些，仓库也能管以下。但由于进销存软件在财务方面管理也难以达到非正规财务管理软件的能力，同时在仓库管理方面比起跨境电商仓库系统缺乏很多功能。在使用初期还可以满足，但由于其本身的局限性，在企业发展到一定阶段后，进销存软件就成为了“鸡肋”。
 
进销存软件适合于刚起步，业务量不是非常大的中小型企业，特别是货物量不是非常多，交易频次不是非常高的情况。在这类企业当中，应用进销存进行财务和仓库方面的管理显得非常的合适，既能够兼顾财务方面又可以管理一定规模的仓库中的货物。选择跨境电商仓库系统，发展中企业的不二选择如果你的企业已经发展到了一定的规模，并且已经具备了开始独立的账务体系和仓储管理部门的化。
 
在选择跨境电商仓库系统的时候，需要中小型企业擦亮双眼，要选择专业的软件供应商提供相应的服务。该供应商一定是要在仓储物流领域深耕多年，具备相应的开发经验，而非做项目的公司，只有这样才能够保障系统的适用性。
 
综上所述，我们给企业的建议是：如果您的企业目前的业务量不大，且在仓库管理方面的要求不是那么的高，可以选择进销存进行过渡。一旦规模上去，就一定要选择财务+WMS系统的方式进行管理。